SearchGUI: Инструмент для исследования в области протеомики
Основные функции
SearchGUI — это интерфейс, созданный для оптимизации исследований в области протеомики. Он помогает идентифицировать объекты, такие как пептиды и белки, и объединяет работу нескольких поисковых систем и алгоритмов.
Настройка параметров поиска
Для начала работы с SearchGUI необходимо настроить параметры поиска. Пользователи вводят имя, выбирают соответствующие файлы спектра и базы данных, а также папку для экспорта результатов.
Настройки поисковых систем
Программа позволяет изменять настройки поисковых систем. Можно задавать минимальные и максимальные значения длины пептидов и массы предшественников, выбирать метод фрагментации, изменять формат вывода и многое другое.
Меню «Соответствие спектров»
В этом меню пользователи могут вводить модификации в области протеомики. Возможности включают добавление фиксированных и переменных модификаций, а также ввод дополнительных данных в разделе «Протеаза и фрагментация».
Адаптация алгоритмов
SearchGUI позволяет адаптировать различные алгоритмы под нужды пользователя. Это включает аннотацию спектра, сопоставление последовательностей, варианты пептидов, анализ фракций и другие методы.
Преимущества программы
- Идентификация объектов, связанных с протеомикой.
- Объединение работы нескольких поисковых систем.
- Широкие возможности настройки параметров поиска и изменения настроек поисковых систем.
- Адаптация различных алгоритмов под нужды пользователя.
SearchGUI — это мощный инструмент для исследователей в области протеомики, который, несмотря на свою специализацию, предлагает множество функций в компактном интерфейсе.
Скачать с официальной страницы SearchGUIПохожие программы
| Категория | Наука/CAD |
| Версия | 4.3.6 |
| Разработчик | PeptideShaker Team |
| Размер | 265 MB |
| Лицензия | Apache License 2.0 |
| ОС |
|