CompuCell3D: моделирование поведения клеток
Введение
Молекулярное моделирование — это увлекательное научное исследование, направленное на изучение человеческого организма. Благодаря ему можно получить ответы на фундаментальные вопросы. Программа CompuCell3D помогает профессионалам точно моделировать и симулировать поведение клеток.
Принцип работы
Программа использует клеточные модели Поттса и алгоритмы Глейзера-Гранера-Хогевега (GGH) для описания поведения отдельных клеток или тканей, органов и организмов. Подход, основанный на решётке, обеспечивает точное решение моделей и масштабирование симуляций и представлений клеток до реальных механизмов.
Чтобы создать симуляцию, пользователи должны определить клетки и описать их взаимодействие в «редакторе моделей». Можно настроить свойства элементов симуляции, включая физические параметры, объёмы и типы клеток. Для проведения исследований необходимо задать амплитуду колебаний и степень вариации, а также начальную конфигурацию клеток. Эти данные можно импортировать из простых файлов. После всех настроек симуляция запускается одним нажатием кнопки «Run».
Дополнительные возможности
Продвинутые пользователи оценят поддержку Python-скриптов и расширений C++, которые позволяют создавать более сложные и точные биологические модели. Во время симуляции можно делать скриншоты и генерировать PIF-файлы из VTK-выходов.
CompuCell33D — мощное решение для биологического моделирования на клеточном уровне. GGH-алгоритм позволяет точно моделировать отдельные клетки или ткани, а продвинутые пользователи могут вставлять Python-скрипты для улучшения анализа.
Плюсы программы:- Позволяет точно моделировать поведение клеток;
- Использует клеточные модели Поттса и GGH-алгоритмы;
- Продвинутые пользователи могут создавать сложные и точные модели с помощью Python-скриптов и C++-расширений.
Похожие программы
| Категория | Наука/CAD |
| Версия | 4.5.0 |
| Разработчик | CompuCell3D Development Team |
| Размер | 57.9 MB |
| Лицензия | Open Source |
| ОС |
|