SearchGUI: Инструмент для исследования в области протеомики

Основные функции

SearchGUI — это интерфейс, созданный для оптимизации исследований в области протеомики. Он помогает идентифицировать объекты, такие как пептиды и белки, и объединяет работу нескольких поисковых систем и алгоритмов.

Настройка параметров поиска

Для начала работы с SearchGUI необходимо настроить параметры поиска. Пользователи вводят имя, выбирают соответствующие файлы спектра и базы данных, а также папку для экспорта результатов.

Настройки поисковых систем

Программа позволяет изменять настройки поисковых систем. Можно задавать минимальные и максимальные значения длины пептидов и массы предшественников, выбирать метод фрагментации, изменять формат вывода и многое другое.

Меню «Соответствие спектров»

В этом меню пользователи могут вводить модификации в области протеомики. Возможности включают добавление фиксированных и переменных модификаций, а также ввод дополнительных данных в разделе «Протеаза и фрагментация».

Адаптация алгоритмов

SearchGUI позволяет адаптировать различные алгоритмы под нужды пользователя. Это включает аннотацию спектра, сопоставление последовательностей, варианты пептидов, анализ фракций и другие методы.

Преимущества программы

• Идентификация объектов, связанных с протеомикой.
• Объединение работы нескольких поисковых систем.
• Широкие возможности настройки параметров поиска и изменения настроек поисковых систем.
• Адаптация различных алгоритмов под нужды пользователя.

SearchGUI — это мощный инструмент для исследователей в области протеомики, который, несмотря на свою специализацию, предлагает множество функций в компактном интерфейсе.

Похожие программы

Planoplan

Planoplan помогает легко проектировать дома и здания в 3D.

MMTTY

Как успешно принимать RTTY-сигналы с помощью программы MMTTY: настройка, подключение, контроль.

Shell and Tube Heat Exchanger Design

Программа позволяет проводить расчёты и анализ эффективности теплообменных аппаратов. Помогает определить наиболее подхо...

GWB - Get wooden beams

Get Wooden Beams помогает найти деревянные балки в чертежах AutoCAD.

Emu71

Emu71 — простой в использовании эмулятор калькулятора HP 71B с множеством функций.

Cartes du Ciel

Программа Cartes du Ciel помогает любителям астрономии изучать звёздное небо.

RoadEng

RoadEng помогает решать задачи в сфере лесного хозяйства: планировать мероприятия, определять характеристики участка.

CompactCalc

Научный калькулятор CompactCalc с редактором выражений

TASSEL

TASSEL помогает изучать эволюционные закономерности, ассоциации признаков и неравновесие по сцеплению.

Winlog Lite

Winlog Lite — программа для понимания принципов работы системы SCADA и создания простых приложений.

Автор статьи: Аркадий Кузнецов